化学工具锦囊

让我们学习化学结构式的标准吧!【应用篇】

本文来自Chem-Station日文版 化学構造式描画のスタンダードを学ぼう!【応用編】  webmaster

翻译投稿 桂圆 校对 HaoHu

在之前的【基础篇】的基础上,我们将继续为大家介绍绘制化学结构式的标准指南

“Graphical representation standards for chemical structure diagrams (IUPAC Recommendations 2008)”
Brecher, J. Pure Appl. Chem. 200880, 277-410. DOI: 10.1351/pac200880020277

化学构造式的标准指南:应用篇

本篇与其说教你画的更易懂,不如把它当做一个能准确画出结构的标准。尤其是在文章里绘制化学结构式的时候,养成从头到尾检查一遍的习惯吧。

在单键末端写上缩略名称

甲基(CH3和Me)是最容易忘记的,不写的话也说得通,但是可以适当地调整一下,来避免混淆它是否是印刷排版的错误。

配位键写为一条实线

我经常看到如右图所示的箭头符号,我想还是要知道这是IUPAC不推崇使用的比较好。

在多个中心配位键的情况下,用实线标记是原则。对于离域的π电子,建议使用实线代替虚线。

环内双键写在内侧

显然,建议这样做。

两个双键夹在中间的碳元素要明显的标记出来

只有在联烯(左一)的情况下是可以用一个点来表示的,但我认为最好要养成好好书写的习惯。

注意原子标签的方向

确保将原子团中涉及的元素连接到实线。如果颠倒过来,结构式的含义将会改变,就会引起混乱和误解。就我自己来说,我就经常看到如下图的三种错误。

用更容易表达四面体前后的方式画立体构型

特别是如右图中的羟基这样的符号,第一眼很难想象它所面向的方向,是一个易于误解的典型模型。

负号使用破折号

因为简单的连字符太短,很难看清,建议使用破折号(en-dash)。

离子键不能在离子对之间画线

为了区别共价键,同时明确指出带电荷的种类,建议使用以下符号。

结束语

在本文列举了许多其他推荐和不推荐的例子,你可能会觉得“诶,连这也有研究吗?” 如果你从未听说过“易于理解且安全的结构公式”,就快速浏览一下吧。不要凭自己的审美主观,能够理解并养成按照国际标准来画结构简式的习惯是对自己有益的。

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