化学部落~~格格

肽配体羧酸Rh催化剂催化的Fc区域选择性抗体修饰法

2017年、莱斯大学・Zachary Ball课题组、使用铑(II)金属肽(肽为配体)作为催化剂、成功开发出了IgG抗体的Fc区域的选择性化学修饰法。运用本方法不会对Fab区域进行修饰,因此不会影响抗体的抗原识别能力、另外不需要改变原有的底物序列、因此可以很简便的实现对抗体或均质抗体-药物偶联物(ADC)的荧光标记。

“A Hexa-rhodium Metallopeptide Catalyst for Site-Specific Functionalization of Natural Antibodies”
Ohata, J.; Ball, Z. T.* J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 12617–12622. DOI: 10.1021/jacs.7b06428

问题设定

蛋白质等的化学修饰作为蛋白质功能化的一种有效地方法论,近年来随着抗体偶联药物(ADC)的发展也受到广泛关注。针对赖氨酸或半胱氨酸的亲核侧链的修饰在过去一直是主流,但由于其高反应性和在蛋白质表面的高暴露性问题,常常无法实现高效的化学选择性修饰,因此使得ADC的构效关系取得・结构解析・再现性问题频发。由于这些问题,近年来的研究主要集中在某些限定的修饰位置,尝试合成均质的ADC。到目前为止,已经报道的比较有效地尝试有:基于蛋白质工程的非天然氨基酸取代方法[1],适用于酶/化学试剂[2]的特殊序列掺入方法。但是,还是由于特定位置的高度化学选择性修饰是一个难题,因此基本上都是伴有着副反应的修饰,特别是对于Fc领域选择性的修饰法一直以来都没有大的突破。

解决手法

Ball等人设计了特殊的多肽配体,开发出了新型多肽铑(II)催化剂、并且利用配体与蛋白质的相互作用,尝试对蛋白质进行C-H插入修饰[3]。但是,一般研究只集中在比较小的蛋白质上,而且常常伴有产率低・修饰不完全等问题。

这次要介绍的论文中,作者以protein A由来的Z结构域肽作为羧酸铑的其中一个配体,与抗体Fc进行区域选择性相互作用,实现了抗体Fc区域的选择性化学修饰

主张的有效性验证

①多肽铑(II)催化剂的设计・合成・结构确定

多肽―抗体复合物的已知晶体(PDB: 1FC2)结构如下图所示,作者的铑催化剂也是根据该单晶结构进行设计的。

(图引用自原论文)

Z结构域的多肽33残基中,除去与金属结合后能引起催化剂失活・诱导凝聚・取用纯化困难的M3与H14[5]、与Rh结合部位集中于E3、E11、E20。作者利用固相合成法合成出目标多肽,然后与Rh2(tfa)1(OAc)3进行配体交换[6]、合成了新型多肽配体的铑催化剂。

② Rh金属肽催化剂催化的反应条件优化

以抗体Fc片段为底物,进行催化反应优化。最终,筛选结果: 抗体(8 μM)、Rh催化剂 (16 μM)、重氮试剂(1 mM)、Ntert-butylhydroxylamine (TBHA) buffered saline with glycerol (total 500 μL, pH 6.4)、10℃、8h为最佳条件。

对Fab·Fc片段分别进行反应,作者发现反应仅在Fc片段进行。另外在以多肽为配体的Rh催化剂与Rh2(OAc)4共存下或者不使用Rh多肽催化剂时,作者证实,当与Fc-结合肽竞争时反应效率降低(分析通过炔烃载体型蛋白质的化学印迹进行[7])。另外,Standard条件下,进行反应后的产物通过MALDI解析后发现生成了单一产物,并且在胰蛋白酶消化后的MS / MS分析表明,Fc区中只有Asn 79被修饰。

另外很有意思的是,从本论文中讨论的结果来看,多个Rh催化中心有利于提高整体的催化活性。作为对照实验,作者分别仅仅对E3、E11、E20进行配体交换,得到的单一Rh中心的催化剂的催化活性与含有多个Rh中心的Rh催化剂活性相比,明显活性要差(产率大幅降低)。很有可能,Rh除了作为催化活性中心作用以外,也有可能作为路易斯酸增强了与抗体的结合能,从而提高了催化活性[8]。

③抗体与搭载分子的适用性与功能评价

抗体侧的适用性:已知的能与proteinA结合的人类,猪,兔,犬IgG抗体都能适用该催化反应。无法结合的牛抗体的修饰度(反应活性)很低。另外老鼠的 IgG抗体虽然能与proteinA结合、有可能是没有合适的反应位点,因此修饰反应无法进行。对人源化抗体药物赫赛汀也能进行修饰。
荧光分子的搭载:对于如上所述用炔烃标签修饰的人IgG和赫赛汀、可以与发红色荧光的螯合物(5a)[9]与发绿色荧光分子FITC(5b)通过Click反应结合。通过对HER2过表达癌细胞株(SK-BR-3)撒上FITC修饰(荧光标记)过的赫赛汀,可以看到细胞周围发光,这表明修饰过的赫赛汀还保持了抗原结合能。

(図は論文より引用)

均质ADC的创制:ADC通过使具有毒素的分子(多柔比星)和用于纯化/检测的标签(脱硫生物素)的化合物6与炔烃修饰的抗体反应来生产。从校准曲线计算抗体 – 药物结合比(DAR)为1:1,并且确认修饰很顺利的进行,产率> 90%。并且得到的ADC保持有对SK-BR-3细胞的结合能。

(図は論文より引用)

Comment

  • Ball组是为数不多的以多肽为配体,利用Rh催化的C-H插入反应为基点,利用配体多肽与一些多肽,蛋白质的相互作用对大分子化合物进行修饰的课题组。在多年的不断的实践中,积累了大量这块的original知识,经验。
  • 抗体具有C2对称性,因此ADC的DAR应该是偶数,在本论文中确是1:1,这一点小编感到挺不可思议的。
  • 使用过渡金属(Rh、Cu)这一点,从残留毒性上来看,是一个比较遗憾的点。对于Rh的毒性虽然报道的比较少,然而应该不比铂低[10]。

次に読むべき論文は?

・抗体结合配体的review[11]。

参考文献

  1. (a) Hofer, T.; Skeffington, L. R.; Chapman, C. M.; Rader, C. Biochemistry 2009, 48, 12047. DOI: 10.1021/bi901744t (b) Axup, J. Y.; Bajjuri, K. M.; Ritland, M.; Hutchins, B. M.; Kim, C. H.; Kazane, S. A.; Halder, R.; Forsyth, J. S.; Santidrian, A. F.; Stafin, K.; Lu, Y.; Tran, H.; Seller, A. J.; Biroc, S. L.; Szydlik, A.; Pinkstaff, J. K.; Tian, F.; Sinha, S. C.; Felding-Habermann, B.; Smider, V. V.; Schultz, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109, 16101. doi:10.1073/pnas.1211023109 (c) Zimmerman, E. S.; Heibeck, T. H.; Gill, A.; Li, X.; Murray, C. J.; Madlansacay, M. R.; Tran, C.; Uter, N. T.; Yin, G.; Rivers, P. J.; Yam, A. Y.; Wang, W. D.; Steiner, A. R.; Bajad, S. U.; Penta, K.; Yang, W.; Hallam, T. J.; Thanos, C. D.; Sato, A. K. Bioconjugate Chem. 2014, 25, 351. DOI: 10.1021/bc400490z
  2. (a) Siegmund, V.; Schmelz, S.; Dickgiesser, S.; Beck, J.; Ebenig, A.; Fittler, H.; Frauendorf, H.; Piater, B.; Betz, U. A. K.; Avrutina, O.; Scrima, A.; Fuchsbauer, H.-L.; Kolmar, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2015, 54, 13420. DOI: 10.1002/anie.201504851 (b) Witus, L. S.; Netirojjanakul, C.; Palla, K. S.; Muehl, E. M.; Weng, C.-H.; Iavarone, A. T.; Francis, M. B. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 17223. DOI: 10.1021/ja408868a (c) Zhang, C.; Welborn, M.; Zhu, T.; Yang, N. J.; Santos, M. S.; Van Voorhis, T.; Pentelute, B. L. Nat. Chem. 2016, 8, 120. doi:10.1038/nchem.2413
  3. Ball, Z. T. Curr. Opin. Chem. Biol. 2015, 25, 98. doi: 10.1016/j.cbpa.2014.12.017
  4. Braisted, A. C.; Wells, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996, 93, 5688.
  5. Sambasivan, R.; Zheng, W.; Burya, S. J.; Popp, B. V.; Turro, C.; Clementi, C.; Ball, Z. T. Chem. Sci. 2014, 5, 1401. doi:10.1039/C3SC53354A
  6. Martin, S. C.; Minus, M. B.; Ball, Z. T. Methods Enzymol. 2016, 580, 1. doi:10.1016/bs.mie.2016.04.016
  7. Ohata, J.; Vohidov, F.; Ball, Z. T. Mol. BioSyst. 2015, 11, 2846. doi:10.1039/C5MB00510H
  8. Vohidov, F.; Knudsen, S. E.; Leonard, P. G.; Ohata, J.; Wheadon, M. J.; Popp, B. V.; Ladbury, J. E.; Ball, Z. T. Chem. Sci. 2015, 6, 4778. doi:10.1039/C5SC01602A
  9. Ohata, J.; Vohidov, F.; Aliyan, A.; Huang, K.; Martí, A. A.; Ball, Z. T. Chem. Commun. 2015, 51, 15192. doi:10.1039/C5CC06099K
  10. https://www.sanei.or.jp/images/contents/290/Rhodium_soluble_compounds.pdf
  11. Kruljec, N.; Bratkovič, T. Bioconjugate Chem. 2017, 28, 2009. DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.7b00335

关联记事

本文版权属于 Chem-Station化学空间 欢迎点击按钮分享,未经许可,谢绝转载!

 

Related post

  1. 计算化学的一点简单科普:DFT计算常用的泛函
  2. 具有金属手性中心的可见光氧化还原催化剂
  3. Angew:铜催化远程对映选择性磺酰化反应方法学
  4. 碳碳双键的形成 第二部分:H-E-W反应的Still改进和Wit…
  5. 手性磷酸催化2-叔丁基氧基酰胺-烯丙基醇的动力学拆分
  6. J. Am. Chem. Soc. 计算化学辅助天然产物全合成
  7. 中药指纹图谱
  8. Angew. Chem. Int. Ed (Hot Paper)…

Comment

  1. No comments yet.

  1. No trackbacks yet.

You must be logged in to post a comment.

Pick UP!

微信

QQ

广告专区

PAGE TOP