研究论文介绍

Vepdegestrant的合成:Cereblon receptor (7)的合成

作者:石油醚

引言

Vepdegestrant(1)是由Arvinas公司与辉瑞(Pfizer)联合开发的一款口服蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)药物,主要用于治疗携带ESR1突变的雌激素受体阳性(ER+)、人表皮生长因子受体2阴性(HER2-)的晚期或转移性乳腺癌患者。

目前,Vepdegestrant(1)的商业化生成工艺主要通过片段10(lasofoxifene衍生物)与片段7(cereblon receptor)的还原胺化高效组装。其中,7合成目前由L-谷氨酸衍生物2经脱Cbz、与芳基哌啶醛5还原胺化得中间体6,再经酸催化脱水/环化制备。该环化需在乙腈中共沸除水,条件剧烈,易产生工艺相关杂质;且延长反应时间或过量使用(S)-樟脑磺酸(CSA)会导致7发生消旋。基于此,辉瑞的科学家希望以醛5与环状酰亚胺12直接经还原胺化一步构建片段7(Figure 1),实现汇聚式合成,兼顾效率提升与杂质可控性。

正文

首先,对关键的中间体12的合成进行研究(Figure 2)。前人研究表明:Cbz-(13)或Boc-保护的L-谷氨酰胺(18)在脱水/活化剂作用下可高效环化。其中,无氨基甲酸酯保护的底物(15)亦可行,但N-苄基谷氨酰胺(16)因立体中心极易消旋,进而不适用。相比之下,氨基甲酸酯保护显著抑制消旋,经高通量筛选确认,EDCI/HOPO组合效果最优。初始采用Cbz保护,后改用Boc保护,收率相当,且省去氢解步骤,工艺更简洁(Scheme 2)。即Boc保护的L-谷氨酰胺(18)为原料,在甲乙酮(15 vol)中,EDCI/HOPO(各1.2 equiv)于80 °C反应1 h,高效环化以75–83% 收率和99:1 er获得19(Scheme 2)。随后在异丙醇(8 vol)中用对甲苯磺酸(2.0 equiv)于50–60 °C脱Boc,冷却至室温析出,以91–95%的收率获得20。该路线成功放大至公斤级,表现与小试一致。

另外一方面,对19的结晶工艺进行了优化,使用丙酮替代之前结晶工艺。18缩合后的反应液在丙酮中回流3–7 h,降温至40–50 °C加水结晶,再冷至0–5 °C,得19(83% yield,er 98.2:1.8–99:1)。手性纯度在19结晶中基本不变;但其下游产物12的对甲苯磺酸盐结晶可稳定提升er(≥98.2:1.8 → ≥99:1)。 强制降解实验表明:19可耐受各类酸,但K₂CO₃/K₃PO₄中明显消旋。丙酮/水结晶工艺完全规避萃取及碱性条件,进而保障手性完整性。然而,延长反应时间(过夜)导致19 er略降至96.8:3.2;而Boc脱除步骤(iPrOH, 60 °C, 24 h)对1912均无消旋影响。此外,盐型筛选显示:12的TFA盐溶解性好,但HCl盐市售品er波动大;相比之下,自制对甲苯磺酸盐(或甲磺酸盐)结晶性好、er稳定、溶解性优于HCl盐,更利于下游工艺。最终选定对甲苯磺酸盐用于后续开发。

其次,对关键的中间体5的合成进行研究(Figure 2)。原路线存在很多缺陷:1中雷尼镍催化腈半还原制醛(15),但存在明显缺陷:2)氰化铜使用不理想,雷尼镍半还原收率(31%),且易生成二聚体杂质24(Scheme 3)。然而,改用 钯催化芳基溴4的甲酰化反应(Scheme 4)直接构建醛基,但其需一氧化碳专用设施,且钯成本高昂,故仅用于开发后期供应。进一步通过(含定向锂化等策略)系统筛选,Scheme 5被确定为最优路径:Step 1:Boc-哌嗪(23)与溴氟苯甲腈(25)在DMSO中高效SNAr反应,加水即结晶得26(96–99%收率);Step 2: 腈26水解为酸27。碱性水解(KOH, 90 °C, 数小时)虽可行,但导致20–40% Boc脱除;需调pH至8–12后重新Boc化,再经柠檬酸酸化、丙醇/水结晶得27(75–90%收率)。为避免Boc反复引入,开发SNAr/水解/Boc保护三步串联工艺:以游离哌嗪(3 equiv)进行SNAr,直接水解中间体26A并Boc化获得27;Step 3:27与iPrMgCl(3–4 equiv)于10–20 °C完成卤素-金属交换,DMF淬灭得醛,自发环化为高结晶性28(70–75%yield,99%纯度)。该结晶步骤为关键纯化节点,彻底清除杂质;Step 4: 28在乙腈中与甲基对甲苯磺酸酯/Hünig碱反应,咪唑淬灭过量试剂,再加水/乙醇直接结晶得目标物5(82–96%收率,99%纯度)。

随后,对于512的还原胺化进行研究。优先选用结晶性更优的乳醇28为底物(Scheme 6),因其可一步转化为内酰胺30,缩短整体路线。筛选还原剂发现,三乙酰氧基硼氢化钠(STAB)效果最佳:副产物少,且能同步促进环化。反应需弱酸性条件(低pH利于乳醇还原);20 °C时胺化顺利、手性保持好,但环化缓慢;升温至40 °C加速环化,却导致er轻微下降(96:4–97:3)。添加三甲基硼酸酯等干燥剂虽可行,但会抑制后续环化。最优条件下,30的分离收率仅65%(er 97:3);幸运的是,其结晶可有效除杂并提升er,但er受搅拌时间调控。

同时,考察以5为原料(Scheme 7):原工艺使用氰硼氢化钠与非环底物3反应,存在缺陷;而换用亲核性更强的环状酰亚胺12后,STAB在DMF或DMAc中即可实现高转化(>95%),醛还原极少(<5%);THF中转化仅72%。DMF中–15 °C至0 °C效果稳定,室温反而降低转化。因收率更高且室温数小时内即可自发环化,甲酯5整体优于乳醇28。进一步筛选发现,极性非质子溶剂(DMF、DMAc、NMP)表现相近(STAB足量时),但结晶后er差异显著:原位er相当,加水析晶后er因成粒时间延长而下降——提示长时间静置易析出外消旋晶型。PXRD证实:99:1 er样品仅单晶型;随时间推移出现第二晶型,疑为外消旋体。结晶机制需深入研究,以实现外消旋体选择性溶解与er最大化。 DMAc用量≥5 vol可确保均相;稀释反应更利于维持高er并抑制双加成杂质33。乙酸(2.0 eq)提升收率,但过量略损er;STAB过量会加剧醛还原及er下降(Table 3);当STAB当量与酰亚胺12盐中酸当量严格匹配时,消旋化最小。实验证实:过量乙酸盐(如KOAc)可引发30消旋,环化阶段为消旋风险最高点。胺(12)过量可抑制双加成杂质33,对醛还原杂质32影响甚微。最终比较12的两种盐形式:12·OTs优于12·HCl,收率更高、er更优,且更有效抑制杂质3233

最后,作者利用上述工艺在实验室制备1.5 kg 30反应条件:采用 512·TsOH(1.2 eq)、STAB(1.1 eq)和 AcOH(2 eq)在 DMAc(12 vol)。后续结晶过程通过分两批加入水(共 8 vol)实现,随后用水和异丙醇洗涤。为考察结晶动力学,批次分两次过滤:2 h 后滤得部分产物 97:3 er;24 h 后滤得部分产物96:4 er。PLM 与 PXRD 显示二者晶型与形貌不同。少量 STAB 过量(1.1 eq)即兼顾高 er 与合理收率(75%)。 进一步优化发现:还原胺化可在 DMAc(4 vol)/MEK(8 vol)混合溶剂中进行(总稀释度同前),环合后经恒体积蒸馏置换 MEK 为水,直接结晶得 30,收率 88%,93:7 er。虽 er 较低,但后续 Boc 脱保护可大幅提升 er,故该高收率路径具实用价值。

除此之外,开发了替代方案,氢化还原胺化(scheme 8):10% Pt/C 为最优催化剂。在 THF/DMAc(2:1, 12 vol)中,2–6 wt% Pt、10–50 psig H₂ 下,转化率达 98–99%,LCAP 78–87%,主杂质为醛过度还原(9–20%),无 er 损失;DMAc 对维持浆液流动性至关重要。氢化后加入 KOAc/AcOH 缓冲液,既利于 Pt 过滤,又调控环化与消旋平衡:0.75 eq KOAc 可控 er 在 95:5–96:4(同 STAB 工艺)。5 g 规模验证得 81% 收率、96:4 er。该路线潜力明确,但需解决醛还原、纯度控制及环化速率慢等问题。 DoE 研究(Figure 3)表明:Pt 用量与 H₂ 压力显著影响结果;2 wt% Pt 需 50–90 psig H₂ 才达最优;温度与预搅拌对转化率无影响,但影响醛还原量(9–20%)。

分离 30 提供关键杂质控制节点:杂质在该步被有效清除,但其结晶 er 受搅拌时间影响。在后续 Boc 脱保护步骤可提升er。对比多种酸,仅 HCl 成盐(乙腈/水,4–5:1 v/v)可稳定提升 er:无论起始 30 的 er 为 97:3 或 93:7,所得 7·HCl 均达 >99:1 er(Scheme 9)(收率 92–93% 或 86–87%)。该工艺已放大至多克级,所得 7·HCl 在后续合成(1)中性能与第一代 7·CSA 完全一致(STAB/NMM/DMAc 条件)。

综上:辉瑞的科学家以环状酰亚胺 12 和醛 5开发了一条合成Vepdegestrant的关键中间体7的新路线。新路线中,环状酰亚胺 12 与醛 5 经高效还原胺化,直接以高收率、高 er(>97:3)得到 Boc 保护中间体 30;随后 HCl 脱保护生成 7·HCl,再经乙腈/水结晶即可将 er 稳定提升至 >99:1,为最终制备Vepdegestrant(1)提供高质量前体。该路线摒弃了原工艺中苛刻的环合条件,实现了 7 的稳健、高纯(化学纯度与 er 均优)制备。

相关链接:

A Second-Generation Route to the Cereblon Fragment of ARV-471, Vepdegestrant

 

 

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