化学工具锦囊

免费的有机化合物的光谱数据库 SpectraBase

作为从事有机化学领域的各位,我想大家在结构测定的时候通常想到的是侧NMR,通过NMR图谱来推测分析化合物的结构。这时候如果是已知化合物的话,那么我们首先想到的是确认下自己测的化合物图谱是不是与已知化合物的图谱吻合。而怎么获得已知化合物的图谱?我想方法有很多,下面为其中一些例子。

  1. 通过SciFinder进行结构式检索,访问实际谱图。
  2. 谷歌搜索关键词「◯◯, 1H NMR」「◯◯, IR」
  3. 用知名频谱数据库「SDBS」进行搜索
  4. 1H NMR或13 NMR 的场合,用ChemDraw的预测谱图大概比对下
  5. 如果自己有样品或者可以买到,那直接自己测下
  6. 不需要搜索,已经在本大神的大脑中都储存了(笑)

一般即使对结构分析非常拿手的资深人士,在拿到一个化合物的时候,如果是已知的也会对比下已知谱图。在这种情况下,拥有一个免费的在线频谱数据库是很有用的。据小编所知,「SDBS」是主流。最近、bio・rad公司公开了其谱图数据库的服务。其名字为

SpectraBase

在这里,小编就来介绍下这个谱图数据库。

首先,BioRad是啥?

bio・rad是1952年成立的美国的企业、该公司在生命科学和诊断领域非常著名。

该公司有许多应用产品,如PCR扩增,生物标记和蛋白质纯化相关等。

这样一个生命科学公司怎么会有一个频谱数据库? 据说这是该公司长期以来一直在进行的服务,这次只是将其免费公开而已。

免费丰富的频谱数据库「SpectraBase」

SpectraBase中的光谱总数约为约70万!这些谱图以IR和Raman为主,但也有许多NMR,MS和UV光谱。能够免费使用这个频谱数据库可是相当赞了。外观很简单。 搜索可以通过复合名称或CAS编号完成。

那么在这里让小编以类固醇激素Progesterone为例,用这个网站搜索下。当用搜索栏搜索时,出现了十种候补化合物。其中包括脱氧的衍生物。当单击Progesterone就出现了下图所示的页面。显示的结构式可以以mo格式下载。该网站中收录的Progesterone的谱图包括、13C NMR就有13种(各种氘代溶剂)、1HNMR有两种、IR, 拉曼、MS、UV-Vis都通通涵盖。

検索例:Progesterone举例

但是需要注册才能查看完整的频谱。 但是,注册是免费的。由于可以用万能的Google账号登陆,因此对小编来说并没有花时间注册账号。

实际显示的图谱

谱图可以随意放大/缩小,并且可以叠加自己的NMR谱图数据。通过点击谱图上部的Overlay Spectrum,导入实际自己测定的NMR数据,即可叠加,很简单的就能对比。

所以它是一个性能非常高的频谱数据库,但有一个缺点。

在尝试搜索了几个化合物的谱图数据后发现,有一些化合物的NMR谱图,在峰型上只显示单峰,有些少峰。小编直接电话问了技术人员,由于很早的时候没有电子数据的,都只有一个化学位移数值的文本数据,当后来录入电子数据的时候,就只能显示单峰。

有兴趣的童鞋们可以尝试用一下这个谱图数据库,还是很强大的哦

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LuWenjie

LuWenjie

京都大学药学博士,现某化学企业小职员,化学空间员工副代表,网页小编&翻译。

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